実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ

ロングリードWET&DRY解析ガイド　シークエンスをもっと自由に！

リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術

荒川和晴，宮本真理／編

2021年09月17日発行
B5判
230ページ
ISBN 978-4-7581-2253-5

定価：6,930円（本体6,300円＋税）
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手のひらに載る超小型「次世代シークエンサー」として大きな注目を浴びたMinIONも，正式リリースからすでに5年が経った．技術的にも成熟し，DNAもRNAも増幅なしで直接読める1分子リアルタイムシークエンサーとして，ナノポアシークエンサーは今さまざまな医薬・生命科学の領域で活用が進んでいる．ゲノムシークエンス技術は今や分子生物学的アプローチに不可欠な存在だ．いつでも，どこでも，誰でもシークエンシングを行える時代を，本書とともに楽しんでいただきたい．…

荒川和晴（慶應義塾大学先端生命科学研究所）

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序
索引

目次・内容紹介
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精度が向上し，導入のしやすさや応用性の高さで新たな強みを示すロングリード技術を活用して新発見を掴むための実践プロトコール集．実例に裏打ちされたWET・DRY双方のノウハウが満載．

序【荒川和晴，宮本真理】

第1章　Introduction

1　序論：誰もがゲノムシークエンシングできる時代に【荒川和晴】

2　ナノポアシークエンスの原理と技術発展【宮本真理】

3　DRY解析環境のセットアップとデータ解析プラットフォームGalaxyの使い方【大田達郎，志波　優】

4　ナノポアシークエンス実践ガイド〜ライブラリプレップから解析環境選びまで【上村泰央】

第2章　プロトコール①　リピートと構造変異

1　動物の長鎖リピート解析（クモ糸を例に）【河野暢明】

2　ヒト疾患関連の長鎖リピート解析【三橋里美】

3　ヒト疾患関連のSV解析【坂本祥駿，三宅修平，岡　実穂，鈴木　穣，鈴木絢子】

4　核酸の塩基修飾解析【古田芳一】

5　メガベースをめざせ！ultra-long readプロトコール【中村浩之，河野暢明，荒川和晴】

第3章　プロトコール②　ゲノムアセンブリ

1　初めてでもできる！細菌ゲノムのアセンブル【谷口　誠】

2　和牛のde novoゲノムアセンブリ【若栗浩幸，今村聖実，佐々木慎二，鈴木　穣】

3　ナノポアで読む植物ゲノム【内藤　健】

第4章　発展的アプリケーション

1　direct RNA sequenceとRNA修飾の情報解析【上田宏生】

2　ナノポア技術によるオンサイト迅速細菌同定【松尾禎之】

3　ナノポアシークエンサーMinIONを活用したウイルス解析【中川　草】

索引

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【本書名】実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ：ロングリードWET&DRY解析ガイド　シークエンスをもっと自由に！〜リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術
【出版社名】羊土社

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