2024年ノーベル化学賞のテーマ「AlphaFold」を扱う本邦初の実験書.どのツールをどう使えばいいか,実践的な解説が満載.本書を片手にタンパク質の「構造」から機能を探り,研究を一つ上のステージへ
目次
◆ 序【富井健太郎】
第1章 概論と基礎知識(仮)
1 構造バイオインフォマティクスへの招待(仮)【富井健太郎】
2 AlphaFold2の衝撃(仮)【大上雅史】
3 AlphaFoldの予測構造を読み解くための基礎知識(仮)【西 羽美】
第2章 立体構造データの入手と可視化・簡易計測(仮)
1 立体構造データの可視化と解析のためのツール(仮)【山守 優】
2 各種立体構造データベースの種類と使い方(仮)【于 健,栗栖源嗣】
3 タンパク質の立体構造予測 〜ColabFoldとAlphaFold2〜(仮)【森脇由隆】
第3章 立体構造によるタンパク質の機能推定(仮)
1 タンパク質–タンパク質の相互作用予測 〜AlphaFold-MultimerとAlphaFold3〜(仮)【森脇由隆】
2 分子ドッキング法 〜タンパク質–化合物複合体の構造予測〜(仮)【石谷隆一郎,力丸健太郎】
3 MDシミュレーション 〜予測構造モデルの安定性や結合の強さを検証する〜(仮)【寺田 透】
4 構造比較 〜立体構造を検索して比較する〜(仮)【木原大亮】
第4章 応用・発展的研究(仮)
1 タンパク質の構造状態の探索 〜AlphaFold と分子動力学の統合〜(仮)【岡崎圭一,大貫 隼】
2 タンパク質デザインAIの動向と利用のコツ(仮)【小林直也】
3 AlphaMissenseによる変異導入効果予測 〜タンパク質言語モデルと立体構造予測の融合(仮)【山口秀輝,齋藤 裕】
◆ 索引
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- 【本書名】実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド〜今日からできる!構造データの基本操作から相互作用の推定、タンパク質デザインまで
- 【出版社名】羊土社
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