リアルな相互作用を捉える近接依存性標識プロトコール

◆ 序【澤崎達也】

◆ 概論―近接依存性ビオチン標識法の原理・実際・応用【小迫英尊】

原理編

1　近接依存性ビオチン標識技術の選び方と解析の注意点【澤崎達也】

2　細胞，マウス個体へのビオチンリガーゼ導入法【奥山一生，谷内一郎】

3　ビオチン化タンパク質の検出・同定法と使い分け【小迫英尊】

実践編

Ⅰ．解析フロー

1　標識酵素融合遺伝子のコンストラクション【高橋宏隆】

2　BioID酵素融合遺伝子の培養細胞への導入【山中聡士】

3　イムノブロットによるビオチン標識の確認【高橋宏隆】

4　ビオチン化タンパク質の精製と質量分析による同定【小迫英尊】

5　近接タンパク質情報のバイオインフォマティクス【土方敦司】

6　in vitroでの生化学的相互作用解析【森下　了】

Ⅱ．各生物種での解析

7　マウス生体内BioID法の実践に向けたマウス作製法とビオチン化誘導法【谷内一郎，原田淳司】

8　AirID融合タンパク質発現シロイヌナズナの作出【野澤　彰，井上晋一郎】

9　出芽酵母におけるAirIDによる相互作用因子の同定【河田美幸，関藤孝之】

10　ショウジョウバエ生体における近接依存性標識プロテオミクス【川口紘平，藤田尚信】

応用編

1　Split-BioID法とその派生技術の可能性【永本紗也佳，髙野哲也，奥山一生】

2　BioID法に用いる酵素の構造的特徴【寺脇慎一】

3　Fab抗体を用した膜タンパク質の細胞外相互作用解析【山田航大】

4　HRP標識抗体を用いた構造特異的膜タンパク質の解析【小川優樹】

5　BioID法で解き明かす生体脳の空間プロテオーム【伊藤有紀，髙野哲也】

6　短時間のPPIを解析するためのBioID酵素【山中聡士】

◆ 索引