正しい結果を得るためのイメージング＆画像解析実践テキスト

◆ はじめに【小山宏史，加藤　輝，亀井保博】

◆ 画像解析のチートシート一覧

第Ⅰ部　画像取得

第1章　画像取得のイントロ

1　なぜ顕微鏡で撮影するだけなのに光学理論まで知らなくてはならないのか？【亀井保博】

2　顕微鏡法の選び方と試料調製【亀井保博】

3　顕微鏡観察を計画する・コンサルを受けるときの心構え【甲本真也，亀井保博】

第2章　光の性質と光学顕微鏡

1　顕微鏡学を理解するための光の性質の基本 〜波の性質を知る【亀井保博】

2　顕微鏡の光学理論の基礎 〜レンズを通る光のふるまいと開口数・倍率・分解能【谷口篤史】

3　明視野顕微鏡法の種類 〜明視野観察法・偏斜照明法・暗視野観察法・位相差観察法・微分干渉観察法【谷口篤史】

4　顕微鏡周辺技術と原理 〜光源と光検出器，デジタル画像【坂本　丞】

第3章　多彩な蛍光顕微鏡

1　蛍光物質と蛍光顕微鏡【坂本　丞】

2　共焦点蛍光顕微鏡【大友康平】

3　二光子・多光子励起顕微鏡【大友康平】

4　超解像顕微鏡 〜STED法，SMLM法，SIM法【堤　元佐】

5　ライトシート顕微鏡【野中茂紀】

第Ⅱ部　画像解析

第4章　画像解析の目的と注意点

1　画像解析で何を知りたいか【加藤　輝，小山宏史】

2　画像処理の前に知っておきたい基礎知識【加藤　輝，小山宏史】

3　画像処理の前に知っておきたい注意点【加藤　輝，小山宏史】

4　特殊なケース【加藤　輝，小山宏史】

第5章　画像解析の前処理

1　画像処理の典型的な手順の概要と例外【加藤　輝，小山宏史】

2　簡単なケース【加藤　輝，小山宏史】

3　画像処理の典型的な手順1 〜物体認識までの工程【加藤　輝，小山宏史】

4　画像処理の典型的な手順2 〜物体認識の精度向上のための工程【加藤　輝，小山宏史】

第6章　画像解析；定量化

1　定量化の概説【加藤　輝，小山宏史】

2　定量化の手法と手順【加藤　輝，小山宏史】

第7章　深層学習の利用

1　深層学習を利用すべきか【渡辺英治，小山宏史】

2　深層学習の概念を理解する【小山宏史】

3　深層学習の基礎【渡辺英治，小山宏史】

4　AI画像解析はじめの一歩【渡辺英治】

Appendix

1　無限遠補正光学系【亀井保博】

2　F値【谷口篤史】

3　散乱【谷口篤史】

4　レーザー【大友康平】

5　二光子励起過程における蛍光強度と励起光強度【大友康平】

6　チャープ補償【大友康平】

7　空間フィルタ（カーネル）【加藤　輝，小山宏史】

8　モルフォロジフィルタ【加藤　輝，小山宏史】

9　多数の画像を処理するためのマクロ【加藤　輝，小山宏史】

10　ROI ManagerでROIを1つずつ指定するためのマクロ【加藤　輝，小山宏史】

◆ 索引

COLUMN

1　組織透明化技術【洲﨑悦生】

2　検出器由来のノイズ【坂本　丞】

3　顕微鏡自作のススメ【勝木健雄】

4　蛍光タンパク質に基づく生理機能指示薬【杉浦一徳，永井健治】

5　生物発光を用いたイメージング【服部　満，永井健治】

6　蛍光の寿命を使ったイメージング【児玉　豊】

7　二光子励起ホログラフィック顕微鏡【的場　修，Manoj Kumar，米田　成，森田光洋，玉田洋介，粟辻安浩】

8　超解像「顕微鏡」がなくてもできる超解像観察 〜SRRF法：時間・空間相関解析による超解像顕微鏡法【堤　元佐】

9　超解像観察のための試料調製法【堤　元佐】

10　蛍光顕微鏡で分子の動態を観る【堤　元佐】

11　光で遺伝子発現を「操作」する顕微鏡技術【坂本　丞】

12　画像間の輝度補正手法【和田裕一】

13　未来のAI【渡辺英治】