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バイオインフォマティクスで悩んでいるWET研究者必見！『バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選』
今日から試せる。コーディングいらずで使える。
バイオデータベースとウェブツールは、生命科学研究者にとってなくてはならないものです。
近年RNA-seqといったオミクス実験が一般的となり、WETの研究者にとっても、バイオインフォマティクスが避けては通れないものになっています。
こんな悩みはありませんか？
「Rなどのプログラミング言語を学んだけれど、自由度が高すぎてコードを書くのが大変」
「バイオインフォマティクスのための便利なツールやデータベースは多すぎて選びきれない」
『バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選』（小野浩雅／編）では、それぞれのツールに精通した専門家が厳選したラボですぐに使える最新のツールについて、その特徴と使い方をご紹介しています。
編集部 A
コーディングいらずで誰でも使えるDBとツールを、画像とともに丁寧に解説していますので、今日からさっそく試せます！
先日開催された「日本生化学大会」の会場でも多くの方に手にとっていただいた話題の新刊です。
こんな方におすすめ
- 生命科学の研究者
- WETメインだけど、バイオインフォマティクスをやりたい方・やっている方
本書のポイント
- 何を選び、どう使い、組合わせることができるのか。DBとツールの全体像を俯瞰し客観的に取捨選択することができる
- コーディングいらずでバイオインフォマティクスができる
- ゲノム、タンパク質構造、代謝物、バリアントなどの解析をサポート
- 論文執筆、図表作成、統計解析に役立つツールも紹介
全8章・70選 研究分野や目的別にDBとツールを紹介
- 第1章 研究を効率化する汎用ツール 統合TV（TogoTV）／Integbioデータベースカタログ／ 生命科学系データベースアーカイブ／FaDA／PlotsOfData／RStudio Cloud／ Code Ocean／protocols.io／figshare／NBRP
- 第2章 文献を調べる･整理する･論文執筆を支援する PubMed／CiNii Research／Mendeley／Zotero／Paperpile／inMeXes／ Allie／Colil bioRxiv／DeepL, Grammarly／Togo picture gallery
- 第3章 ゲノム･遺伝子･NGS データを調べる CBI Genome Data Viewer／UCSC Genome Browser／ Ensemble Genome Browser／Plant GARDEN／Microbiome Datahub, PZLAST／NCBI RefSeq／GGRNA／NCBI BLAST／GGGenome／ Sequence Read Archive（SRA）／Digital Expression Explorer 2
- 第4章 ゲノム編集実験を支援する CRISPRdirect／CRISPOR／inDelphi／PrimeDesign／TIDE／CRISPResso2
- 第5章 タンパク質やその立体構造について調べる UniProt／jPOST／PDBj／Molmil／HOMCOS／AlphaFoldDB
- 第6章 実験の結果を解釈する TogoID／NCBI Gene Expression Omnibus（GEO）／Expression Atlas／ ChIP-Atlas 2.0／DAVID／Metascape／Enrichr／BioCyc／Reactome／ iDEP，BioJupies，RaNA-seq
- 第7章 化合物･代謝産物･糖鎖を調べる PubChem／ChEMBL／HMDB（Human Metabolome Database）／ MetaboAnalyst／GlyCosmos
- 第8章 疾患に関するゲノムやバリアントを調べる dbSNP／gnomAD／ClinVar／DECIPHER／GWAS Catalog／PolyPhen-2／ DBKERO
研究の現場で役立つツールを厳選して紹介。どの分野の方にも役立つ内容が満載！
編集部 A
それぞれの記事の冒頭の「このツールでできること」でツールの用途がひと目でわかります。
「序にかえて」を立ち読みできます！
編集部 A
SNSでも「困ったときに辞書的に使えそう」という声をいただいております。
まずは目次をみて知らないツールがないかチェックしてみていただけますと幸いです。
さらなる理解と実践に─ おすすめの書籍
