■ はじめに【馬場健史】

基礎編：質量分析法の基本知識

1　質量分析法の使い分けガイド　測りたいサンプルはどうやって分析するの？【馬場健史】

2　速習 マススペクトロメトリー　MSとMS/MSについて【松田史生】

3　速習 GC/MS　GCカラムとEI，CI【及川　彰】

4　速習 LC/MS　ESI法とLCカラム【山本敦史】

5　速習 MALDI-MS【三浦大典】

6　速習 プロテオミクス　測定モード（DDA，SRM，MRM，DIA）について【松本雅記】

7　速習 無機イオン分析　ICP-MSの原理と得られるデータ【谷水雅治】

8　速習 質量分析法を用いた定量分析【松井誠一】

実践編：各分野の手法別の活用プロトコール

Ⅰ　代謝物

1　LC-MS ターゲット分析　中性糖およびフラボノイド類の一斉解析【及川　彰，佐々木亮介】

2　LC-MS/MS ターゲット分析　臨床バイオマーカー探索を始める前に【野見山倫子，瀬戸山大樹】

3　LC-MS/MS ターゲット分析　低分子バイオマーカーの定性・定量【前川正充】

4　LC-MS/MS ターゲット分析　生体試料における薬物由来の代謝物を探る【佐々木智子】

5　GC-MS ターゲット分析　培地成分・組織で特定のアミノ酸を精確に定量する【岡橋伸幸】

6　LC-MS マルチターゲット分析　培養細胞でエネルギー代謝を定量する【和泉自泰】

7　GC-MS マルチターゲット分析　食品の揮発性成分を一斉分析・定量する【飯島陽子】

8　LC-MS/MS ノンターゲット／ターゲット分析　機能性成分を定量する【市来弥生，酒井美穂，十一浩典】

Ⅱ　タンパク質

1　試料調製　ゲル内消化【小林大樹】

2　試料調製　相間移動溶解法（PTS法）【増田　豪】

3　試料調製　SP3法【川島祐介】

4　定量解析　DIAによるラベルフリーシングルショットプロテオーム解析【川島祐介】

5　定量解析　SILAC法による定量プロテオミクス【幡野　敦，松本雅記】

6　定量解析　内部標準ペプチドを用いたタンパク質絶対量の定量【大槻純男】

7　定量解析　アイソバリックタグを用いた定量解析【津曲和哉，小形公亮，石濱　泰，今見考志】

8　機能プロテオミクス　IP-MS法【足達俊吾】

9　機能プロテオミクス　近位依存性ビオチン化標識法【松本雅記】

10　機能プロテオミクス　リン酸化プロテオーム解析【足立　淳，新藏秋奈】

11　機能プロテオミクス　タンパク質末端ペプチドの濃縮【石濱　泰，西田紘士，津曲和哉】

12　機能プロテオミクス　ユビキチン化プロテオーム解析とユビキチン鎖絶対定量【佐伯　泰，土屋　光，遠藤彬則，冨田拓哉】

Ⅲ　検査・材料・無機

1　食品・環境の検査　食品・環境の検査における分析【坂井隆敏】

2　食品・環境の検査　ターゲット分析における分析方法の妥当性評価【小林憲弘】

3　食品・環境の検査　試料の採取および保存【木村久美子】

4　食品・環境の検査　有機汚染物質の質量分析のための前処理【中田典秀】

5　食品・環境の検査　AIQSを用いた1,000物質のスクリーニング分析【門上希和夫，中島大介】

6　MALDI-MSによる微生物迅速同定のための試料調製法【寺本華奈江】

7　MALDI-TOFMSを用いた高分子材料分析【佐藤貴弥】

8　無機分析【谷水雅治】

発展編：発展的な分析法や役立つ情報など

Ⅰ　発展的分析法

1　細胞核プロテオミクスの現状【幡野　敦，松本雅記】

2　co-fractionation MS　新たな網羅的タンパク質複合体解析法【𠮷川治孝】

3　HDX-MSの概要と活用事例【山口祐希，野田勝紀，池田智彦，内山　進】

4　血漿ぺプチドーム解析技術による生理活性ペプチド探索【小寺義男】

5　ゲル電気泳動を活用したトップダウンプロテオミクス【武森信曉】

6　安定同位体標識を活用した代謝フラックス解析【松田史生】

7　1細胞プロテオームと1細胞メタボロームの技術開発【和泉自泰】

8　新しいフラグメンテーション【高橋秀典，高原健太郎，建田　潮】

Ⅱ　役立つ情報

1　プロテオームデータリポジトリ【奥田修二郎】

2　オンラインツールを活用した低分子マススペクトルの解析【松田史生，三枝大輔】

Ⅲ　各分野での質量分析計の活用例

1　バイオ医薬品【川瀬直樹，川崎ナナ】

2　新規汚染物質の探索における質量分析の活用【山本敦史】

3　法医学における質量分析の活用【奈女良 昭】

■ 索引

■ 執筆者一覧