「マルチオミクス研究」を始めたい!あるオミクスで見えた生命現象の断面を,いかに他の階層の断面とつなぎ合わせ,全体像を掴むのか?マルチオミクスの考え方から,データ取得の実験ノウハウ,解析・統合のインフォマティクスまで.それぞれの状況に応じたアプローチと,オミクスデータの統合解析や技術拡張を紹介し研究を躍進させる1冊!
目次
序
執筆者一覧
本書の使い方
第1章 マルチオミクス研究を始める前に
1. 本書の概要と,実験を始める前に考えること【大澤 毅】
2. マルチオミクス研究における解析戦略と環境整備【島村徹平】
第2章 各オミクスによるデータ取得
1. ゲノム・エピゲノムのデータ取得【永江玄太】
2. トランスクリプトームのデータ取得【金井昭教,鈴木絢子,鈴木 穣】
3. 1細胞CRISPR解析によるデータ取得【加藤真一郎】
4. Ribo-Seqのデータ取得【山下 映,岩崎信太郎】
5. プロテオミクスのデータ取得【松本雅記】
6. 1細胞グライコームのデータ取得【舘野浩章】
7. メタボロームのデータ取得【曽我朋義】
8. ノンターゲットリピドミクスのデータ取得【内野春希,有田 誠】
第3章 各オミクスにおけるデータ解析
1. ゲノム解析【中村 航,坂本祥駿,白石友一】
2. CustardPyを用いたゲノム立体構造解析【長岡勇也,中戸隆一郎】
3. scRNA-Seq解析【萩原 柾,大倉永也】
4. scATAC-Seqによる転写制御解析【河口理紗,堀江健太】
5. マルチオミクス1細胞動態推定【島村徹平,野村怜史】
6. 空間トランスクリプトーム解析【鈴木絢子,金井昭教,鈴木 穣】
7. 1細胞摂動解析【島村徹平,廣瀬遥香】
8. メタボロームデータ解析と実験デザイン【松田史生】
9. メタゲノム解析【森 宙史】
10. マルチオミクスデータの解析【阿部 興,島村徹平】
第4章 各研究におけるマルチオミクス実験・解析の実例
1. 2型糖尿病に伴う糖代謝変化と制御のマルチオミクス解析【大野 聡,黒田真也】
2. 循環器疾患のマルチオミクス解析【野村征太郎】
3. 脂肪細胞分化におけるマルチオミクス解析【松村欣宏,伊藤 亮,米代武司,稲垣 毅,酒井寿郎】
4. 腫瘍微小環境におけるマルチオミクス解析【大澤 毅】
5. 長寿研究におけるマルチオミクス解析【佐々木貴史,新井康通】
6. 脳とマルチオミクス解析【酒井誠一郎,津山 淳,七田 崇】
索引
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- 【本書名】実験医学別冊:実験デザインからわかる マルチオミクス研究実践テキスト〜実験・解析・応用まで現場で使えるプログラムコード付き完全ガイド
- 【出版社名】羊土社
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