序

腸内細菌の分類表

第1章　腸内細菌叢の基本を理解しよう

1　腸内細菌叢は遺伝子情報で解析できる

❶ 培養法からメタゲノム解析に

❷ ショットガンメタゲノム解析からロングリードに

❸ エンテロタイプ分類

❹ 新エンテロタイプ分類

❺ メタゲノム vs ヒトゲノム

❻ 糞便から粘膜局所に

2　日本人腸内細菌叢の特徴は？

❶ 民族，地域ごとに特徴的な細菌叢が形成される

❷ 日本人ではおもに発酵により生じた水素が酢酸生成に消費される

❸ 腸内細菌叢には性差がある

❹ 発酵食品が日本人の腸内細菌叢に影響する

3　母子環境が決める腸内細菌叢

❶ 妊娠時の母親の食が出生児に与える影響

❷ 胎児の腸にも母親由来の腸内細菌が存在する

❸ 帝王切開は児の腸内細菌に影響するか？

❹ 出生後3年程度で個人の腸内細菌叢が安定化する

❺ 母子環境が与える影響を調査するコホート研究がはじまっている

4　幼少時ストレスによるディスバイオーシス

❶ 幼少時ストレスが将来の免疫関連疾患のリスクになる

❷ 母親のディスバイオーシスによる養育障害が仔の発達障害に関与する

❸ 過敏性腸症候群の病態に幼少時ストレスが関与する

❹ 子どもの行動に影響する腸内細菌と家族の絆

❺ 大腸がんの増加にも幼少時ストレスが関与する

5　高脂肪食が変える腸内細菌叢

❶ 腸内細菌叢は高脂肪食によりすぐに変化する

❷ 脂肪吸収には腸内細菌が関与する

❸ 高脂肪食は胆汁酸の代謝を変化させる

❹ 腸内環境を予測し，診断・治療につなげるマーカーとしての胆汁酸プロファイル

❺ 高脂肪食は末梢型時計遺伝子のリズムを乱す

6　食物繊維と腸内細菌叢

❶ 食物繊維の摂取が生活習慣病リスクを減らす

❷ 食物繊維の摂取量が腸内細菌叢を変動させる

❸ 世代を超えて腸内細菌叢の多様性が低下する

❹ 食物繊維欠乏は腸管バリア機能を低下させる

❺ 食物繊維はインフルエンザ感染を抑制する

❻ 大腸がんサバイバーに必要な食物繊維

7　ディスバイオーシスと腸管粘液層

❶ 粘液減少が先か？ ディスバイオーシスが先か？

❷ 粘液減少を引き起こす環境要因

❸ 免疫グロブリンAは腸内細菌を制御する

❹ 小腸抗菌ペプチドが腸内細菌叢を決める

8　腸内細菌叢に影響する環境要因

❶ 食習慣は腸内細菌叢に影響する

❷ 都市化がヒト腸内細菌叢に影響する

❸ 使用している薬剤，大丈夫ですか？

❹ 拡散する化学物質

❺ 人工甘味料，食品添加物をめぐる議論

9　腸内細菌叢に影響する宿主遺伝子

❶ やせ菌の存在にも宿主遺伝子が影響する

❷ 母乳が支えるビフィズス菌の定着

❸ 日本人にビフィズス菌が多い理由は？

❹ ビタミンD受容体遺伝子と腸内細菌叢

❺ 日本人腸内細菌叢に影響する宿主遺伝要因が明らかに

10　腸内細菌叢解析からその代謝物解析に

❶ 短鎖脂肪酸

❷ 乳酸

❸ コハク酸

❹ 脂質代謝物

❺ ポリアミン

❻ トリメチルアミン（TMA） ・トリメチルアミンオキシド（TMAO）

❼ N-アシルアミド

❽ 胆汁酸

❾ 4-クレゾール

❿ トリプトファン代謝物

⓫ D-アミノ酸

第2章　腸内細菌叢と疾患研究でわかっていること，いないこと

1　炎症性疾患・免疫関連疾患

❶ 炎症性腸疾患（IBD）

❷ アレルギー疾患

❸ 関節リウマチ

❹ Clostridioides （Clostridium）difficile 感染症：CDI

❺ 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）

2　代謝性疾患

❶ 糖尿病

❷ 肥満症

❸ 脂肪肝・脂肪肝炎

❹ 骨粗鬆症

3　がん・腫瘍免疫

❶ 食道がん

❷ 胃がん

❸ 大腸がん

❹ 肝がん

❺ 膵がん

❻ 免疫チェックポイント阻害薬と腸内細菌叢

4　脳腸相関と精神・神経系疾患

❶ 脳腸相関

❷ うつ病，うつ状態

❸ 抗加齢医学と腸内細菌叢

❹ 多発性硬化症（MS）

❺ パーキンソン病

❻ 筋萎縮性側索硬化症

❼ 自閉症関連疾患

5　腎・心・血管系疾患

❶ CKD（慢性腎臓病）

❷ 冠動脈疾患

❸ 動脈硬化

❹ 脳卒中

❺ 高血圧症

6　機能性消化管障害

❶ 機能性ディスペプシア（FD）

❷ 過敏性腸症候群（IBS）

❸ 慢性便秘症

❹ 慢性下痢症

7　産婦人科疾患

❶ 不妊症

❷ 多嚢胞性卵巣症候群（PCOS）

❸ 子宮内膜症

❹ 細菌性膣炎

8　スポーツ・疲労・不眠

❶ スポーツ

❷ 慢性疲労症候群

❸ 不眠

第3章　腸内細菌叢を標的にした治療にはどんなものがあるか

1　医薬品としてのプロバイオティクス

❶ 臨床医が知っておくべき薬の分類

❷ プロバイオティクスとは

❸ 耐性乳酸菌製剤

❹ ビフィズス菌製剤

❺ 酪酸菌製剤

❻ プロバイオティクスの今後の活用

2　診療ガイドライン・メタ解析からみたプロバイオティクスの位置づけ

❶ 慢性便秘症

❷ 過敏性腸症候群

❸ Clostridioides （Clostridium）difficile 感染症：CDI

❹ H.pylori除菌療法

❺ 炎症性腸疾患（IBD）

❻ 小児急性胃腸炎

❼ 乳児壊死性腸炎

❽気道感染症

❾ アトピー性皮膚炎

3　乳酸菌とその機能性

❶ 保健機能食品の分類

❷ 乳酸菌研究から新知見が得られています

❸ 発酵と植物性乳酸菌

4　ビフィズス菌とその機能性

❶ ビフィズス菌の概要

❷ Bifidobacterium bifidum

❸ Bifidobacterium breve

❹ Bifidobacterium longum subsp. Longum

❺ Bifidobacterium longum subsp. infantis

❻ Bifidobacterium longum BB536

❼ 加熱処理したビフィズス菌が有効？

5　酪酸菌とその機能性

6　機能性表示食品の新展開

❶ 機能性表示食品の展開

❷ アレルギー症状を軽減する

❸ 尿酸値の上昇を抑える

❹ 免疫機能の維持・改善

❺ 肌の保護

❻ 骨密度を高める

7　次世代善玉菌

❶ フェカリバクテリウム（Faecalibacterium prausnitzii）

❷ アッカーマンシア（Akkermansia muciniphila）

❸ ロゼブリア（Reseburia）

❹ ロイテリ菌（Lactobacillus reuteri）

❺ ミックスプロバイオティクス

8　糞便微生物移植療法の新展開

❶ C. difficile感染症（CDI）に対するFMT

❷ 炎症性腸疾患に対するFMT

❸ 機能性消化管障害に対するFMT

❹ 移植片対宿主病（GVHD）に対するFMT

❺ FMTの現状

9　高発酵性食物繊維による腸内環境改善策

❶ プレバイオティクス

❷ 高機能性オリゴ糖

❸ 高発酵性食物繊維

❹ 日米で異なる食物繊維

❺ シンバイオティクス

10　ファージセラピーの臨床

❶ ファージと腸内細菌

❷ ファージセラピーの効果

❸ ビッグデータの応用

索引