序に代えて:蛋白質研究のすすめ-ゲノム医科学とプロテオーム研究の発展をめざして【新井賢一】

概論:プロテオームとシグナルネットワーク研究【竹縄忠臣】

第1章　ポストゲノム研究としてのシグナル蛋白質研究

1)多彩な蛋白機能解明を目指してのプロテオーム

1　ゲノム科学とプロテオーム解析【菅野純夫】

2　プロテオーム解析の原理と応用【大海　忍】

3　ミクロの世界の擬態【中村義一】

2)プロテオームとドメイン構造(分子間相互作用)

1　癌研究におけるYeast Two-hybridシステムによる相互作用分子の解明【渡邉俊樹】

2　プロテインバイオチップの開発とプロテオミクスへの応用【Steffen　Nock／　Julie　Heinrich／　Lawrence　K.　Cohen／　Peter　Wagner　(翻訳:山崎大輔)】

3)構造解析による分子間相互作用研究

1　無細胞蛋白質合成系とNMRによる蛋白質基本構造の解析【木川隆則／横山茂之】

2　マルチドメイン蛋白質複合体のX線結晶構造解析【箱嶋敏雄】

4)プロテオームの応用例

1　プロテオームを利用した癌研究【長野光司】

2　病態研究へのプロテオーム応用【大森　彬】

3　プロテオームを利用した老化のプロファイリング【戸田年総】

第2章　シグナリングを担うドメイン構造とその機能

1)シグナルネットワークを構築するドメイン構造

1　アダプター／ドッキング蛋白質によるネットワーク【山梨裕司】

2　ドメイン構造からみた活性酸素生成のシグナリング【住本英樹／伊藤隆司】

3　IRSとシグナリング【小川　渉／春日雅人】

4　アダプター・ドッキング蛋白質のノックアウトによる機能解析【堺　隆一】

2)リン酸化と脱リン酸化

1　プロテインキナーゼドメインとリン酸化配列【安藤祥司／稲垣昌樹】

2　ホスファターゼドメインと標的リン酸化部位-特に基質特異性について【菊池　九二三／島　礼】

3　チロシンまたはセリン／スレオニンリン酸化部位を認識するドメイン-SH2／PTB／14-3-3【後藤典子】

3)短いペプチドを認識するドメイン

1　分子集積におけるPDZ蛋白質の役割【西村　渉／田中紀章／畑　裕】

2　EHドメインを有する蛋白質によるエンドサイトーシスの制御機構【刈屋憲次／菊池　章】

4)プロリンに富む配列を認識して結合するドメイン

1　SH3とWWドメインによる認識機序【神田大輔】

2　EVH1ドメインによる細胞骨格の制御【加藤真良】

5)核内シグナル

1　ヘリックス・ループ・ヘリックス(HLH)蛋白質の構造的基盤【清水敏之／箱嶋敏雄】

2　Etsドメインとシグナル伝達【及川恒之】

3　RINGフィンガードメインとユビキチンリガーゼ活性【宮内康弘／森實芳仁／本多玲子／安田秀世】

4　ウィングドヘリックス／フォークヘッド・ドメインの多様性【西村善文】

5　RNA結合蛋白質によるシグナル応答【井上俊介／岡村勝友／塩見春彦】

6)その他のドメイン

1　カルシウム結合モチーフとカルモデュリン結合モチーフ【伊倉光彦／Kyoko(京子)L.　Yap／Justin　Kim／Tao　Yuan】

2　脂質結合ドメインを介したイノシトールリン脂質の機能発現ーPH・ENTHドメイン／FYVEフィンガー【伊藤俊樹】

3　アンキリン・ドメインをもつ蛋白と身体の非対称性決定【横山尚彦】

4　VPH／WH2ドメインとアクチン重合調節【末次志郎】