１章　PCRをはじめる前に−基礎知識と準備−

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（１）概論−PCRの基礎と各項目へのナビゲーション◇佐々木 博己
　　　⇒PCRの基本原理を知る
（２）目的別に使いわけるDNAポリメラーゼ◇青柳一彦
　　　⇒DNAポリメラーゼの種類と特徴を知る
（３）PCRの装置の選び方◇青柳一彦
　　　⇒サーマルサイクラーの種類と特徴を知る
（４）多様な鋳型DNA，RNAの調製法◇佐々木 博己
　　　⇒鋳型の種類と調製法を知る
（５）プライマーの設計◇崎山徳起
　　　⇒プライマー設計の基本と注意点を知る

２章　目的の遺伝子を増やす・伸ばす

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（１）ゲノムPCR法◇河野隆志
　　　⇒目的のゲノムDNA断片を増幅する
（２）コロニーやプラークからの直接PCR法◇佐々木 博己
　　　⇒コロニー，プラークからインサートDNAを増幅する
（３）生体試料からの直接PCR法◇西村直行
　　　⇒生体試料から目的のDNAを増幅する
（４）LA-PCR法◇佐々木 博己
　　　⇒長いDNAを正確に増幅する
（５）Inverse PCR法◇佐々木 滋，河野隆志
　　　⇒既知のDNA領域に隣接する未知のDNA領域を増幅する
（６）T7 transcriptionによるmRNA増幅とRT-PCR法◇大幸宏幸
　　　⇒mRNAの定量，少量のmRNAからcDNAを合成する
（７）RACE法とSLIC法◇檀上稲穂
　　　⇒mRNAの５’末端，３’末端領域をクローニングする

３章　遺伝子の構造・発現解析をする

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（１）PCR産物のクローニングとその目的◇佐々木 博己
　　　⇒PCR産物をクローニングし，さまざまな遺伝子解析に用いる
（２）PCR産物の塩基配列の決定：ダイレクトシークエンス法
　　　◇河野隆志，新井康仁
　　　⇒多型，変異の同定，さまざまなPCRで増幅したDNA断片を確認する
（３）PCRを用いた遺伝子の変異導入法◇増井良治，岩井孝吉，倉光成紀
　　　⇒各種変異を目的の位置に導入する
（４）遺伝子多型・変異の検出：
　　　PCR-RFLP法，完全欠失検出法， PCR-SSCP法，WAVE法◇河野隆志
　　　⇒多型，変異を検出する
（５）マイクロアレイの弱点をフォローする遺伝子発現解析法◇青柳一彦
　　　⇒マイクロアレイを使わずに複数の遺伝子の発現量を解析する，
　　　　新規の遺伝子を同定する
（６）Real-time PCR法◇西岡真輔，河野隆志
　　　⇒遺伝子の発現量を測定する
（７）メチル化解析：Methylation specific PCR法◇西岡真輔，河野隆志
　　　⇒遺伝子のメチル化の頻度を知る
（８）テロメラーゼ活性の測定◇佐々木 博己
　　　⇒テロメラーゼ活性のPCRによるビジュアル化
（９）Multiplex RT-PCR法◇森 和彦
　　　⇒１本のチューブ中で複数の遺伝子の発現を定量する
（10）DegenerateおよびUniversalプライマーの活用法◇佐々木 博己
　　　⇒遺伝子ファミリーの網羅的発現解析，新規遺伝子ファミリーの同定，
　　　　新規細菌の同定，感染細菌の構成を把握する

４章　ごく少量のサンプルを網羅的遺伝子解析に利用する

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（１）完全長cDNAの単離：オリゴキャッピング法◇鈴木 穣，菅野純夫
　　　⇒完全長cDNAライブラリーを作製する
（２）全ゲノムDNAの増幅と半永久保存：PRSG法を中心として◇佐々木 博己
　　　⇒全血DNAを網羅的に増幅し，保存する
（３）均一微少組織標本からの全ゲノムDNAの増幅 ：LCM-PRSG法
　　　◇佐々木 博己
　　　⇒均一微少組織標本からDNAを網羅的に増幅し，保存する
（４）マイクロアレイ解析のための微量RNAの増幅法：TALPAT◇青柳一彦
　　　⇒微少RNAを網羅的に増幅する

付録：本書で紹介している主なキット＆試薬一覧