ペプチドを対象とした質量分析では，そのアミノ酸配列をより高い精度で同定するため，タンデム質量分析（MS/MS）が行われる．すなわち，一段目のMSで質量を得たプリカーサーイオンをアミノ酸レベルで部分的に分解し，生じたプロダクトイオンの質量もモニターする．この分解過程には，従来，イオンと不活性ガスとの衝突を利用したCIDという方法が用いられてきた．最近になって，よりマイルドな条件で化学的に分解させるETDという方法も開発されている．これらのプロダクトイオンの分解パターンをモニターすることで，アミノ酸の配列情報まで得られることになる．一方，アミノ酸の理論質量とプロダクトイオンの差分から，どのアミノ酸上に修飾基が導入されているかも特定できる．（実験医学増刊305より）

シグナル伝達研究最前線2012

翻訳後修飾，解析技術，疾患との連関から創薬応用まで

井上純一郎，武川睦寛，徳永文稔，今井浩三／編