抗体のVHならびにVLの遺伝子は，抗体産生細胞で起こるV遺伝子断片の再編成によって構築される．VHのV遺伝子断片には，V，D，J遺伝子があり，ヒトゲノム上に，それぞれ39，25，6個並んだ遺伝子群を形成している．VLでは，VとJ遺伝子が，κ鎖で36と5個，λ鎖で36と7個それぞれ存在する．それぞれの異なるV遺伝子断片の組合わせにより，抗体はV領域でのシークエンスの多様性を獲得することができる．加えて，V遺伝子断片の接合のしかたが不正確なため，超可変領域CDR3のシークエンスの多様性はさらに増大する．
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