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k-mer解析

KMERかいせき

k個の連続した塩基配列の出現頻度を計算し,配列内の共通のパターンや差異を検出する配列解析手法.解析結果は,リードマッピングやゲノムアセンブリ,遺伝子発現解析などにも利用される.配列全体を取り扱うよりも高速であり,並列化も容易であることから,大規模なデータを取り扱うバイオインフォマティクス分野でよく利用される.(実験医学増刊4215より)

“情報”から“マテリアル”へ ノンコーディングRNA研究

機能分子としてのRNAを見つけ、知り、創薬に使う新時代

中川真一,廣瀬哲郎,松本有樹修/編

解説は発行当時の掲載内容に基づくものです

本コンテンツは,2018年まで更新されていた同名コンテンツを元に,新規追加・再編集したものです