Genotype-Tissue Expression
Genotype-Tissue Expressionプロジェクトは米国ブロード研究所(Broad Institute)をはじめとする南北米および欧州の複数の研究機関からなる国際コンソーシアムである.ヒトの体組織ごと,遺伝子型ごとの遺伝子発現を網羅的に調べている.そのポータルサイトであるGTEx Portal(https://www.gtexportal.org/home/)では,GTExプロジェクトで収集・解析された遺伝子の発現量や関連するeQTL(expression quantitative trait locus:遺伝子の発現量に影響を与える座位)などのデータがまとめられている.(実験医学増刊422より)
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GTEx projectとは,ヒトの遺伝的多型が,各組織における遺伝子発現にどのような影響を与えるかを解明することを目的としたプロジェクト.GTExの解析した検体は検死となったご遺体から採取したもので,厳密に“健康な”ヒト由来とは言えないが,少なくとも感染症患者由来の検体ではない.(実験医学2022年8月号より)
公共シークエンスデータ解析によるウイルス研究の射程実験医学2022年8月号解説は発行当時の掲載内容に基づくものです
本コンテンツは,2018年まで更新されていた同名コンテンツを元に,新規追加・再編集したものです