uniform manifold approximation and projectionの略．2018年に提案された比較的新しい手法で，主成分分析で得られた主成分をさらに圧縮することで細胞の分類を可視化するための新しい次元圧縮法．細胞ごとのデータから，細胞を分類して可視化するために一般的に用いられている統計解析手法．（実験医学増刊4115より）

マルチオミクス　データ駆動時代の疾患研究

がん、老化、生活習慣病　最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明

大澤　毅／編

UMAPはt-SNEと同様に生命科学の分野では特にシングルセルRNA解析で非常によく用いられている次元削減および可視化手法である．t-SNEと比べて，高速かつ低メモリで計算を実行可能なことが特徴であるため，t-SNEが使われていた分野で急速にUMAPへと切り換えが進んでいる．しかしながら，パラメータ設定しだいでt-SNEでも同様の速度や結果が得られる等の反論もある．（実験医学増刊3820より）

機械学習を生命科学に使う！

シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか？

小林徹也，杉村　薫，舟橋　啓／編