実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:リアルな相互作用を捉える近接依存性標識プロトコール〜BioID・TurboID・AirIDの選択・導入から正しい相互作用分子の同定まで、論文には書かれていない実験のノウハウ
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実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ

リアルな相互作用を捉える近接依存性標識プロトコール

BioID・TurboID・AirIDの選択・導入から正しい相互作用分子の同定まで、論文には書かれていない実験のノウハウ

  • 澤崎達也,小迫英尊/編
  • 2024年09月24日発行
  • B5判
  • 174ページ
  • ISBN 978-4-7581-2274-0
  • 7,590(本体6,900円+税)
  • 在庫:あり
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近年開発された近接依存性ビオチン標識法は,生体内における相互作用因子やオルガネラの構成因子を大規模に同定できる強力な技術である.この方法にはいくつかの種類があり,幅広い生物種でさまざまに活用されている.本稿ではそれらの概要を紹介したい.…

小迫英尊(徳島大学先端酵素学研究所藤井節郎記念医科学センター細胞情報学分野)

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細胞内での相互作用分子を網羅的に捉える技術として,急速に普及するビオチン標識法.ノイズに惑わされない正しい同定を導く戦略やコツから,様々な生物種での応用例まで,本書さえあれば今すぐあなたも実践できる!

目次

◆ 序【澤崎達也】

◆ 概論―近接依存性ビオチン標識法の原理・実際・応用【小迫英尊】

原理編

1 近接依存性ビオチン標識技術の選び方と解析の注意点【澤崎達也】
2 細胞,マウス個体へのビオチンリガーゼ導入法【奥山一生,谷内一郎】
3 ビオチン化タンパク質の検出・同定法と使い分け【小迫英尊】

実践編

Ⅰ.解析フロー

1 標識酵素融合遺伝子のコンストラクション【高橋宏隆】
2 BioID酵素融合遺伝子の培養細胞への導入【山中聡士】
3 イムノブロットによるビオチン標識の確認【高橋宏隆】
4 ビオチン化タンパク質の精製と質量分析による同定【小迫英尊】
5 近接タンパク質情報のバイオインフォマティクス【土方敦司】
6 in vitroでの生化学的相互作用解析【森下 了】

Ⅱ.各生物種での解析

7 マウス生体内BioID法の実践に向けたマウス作製法とビオチン化誘導法【谷内一郎,原田淳司】
8 AirID融合タンパク質発現シロイヌナズナの作出【野澤 彰,井上晋一郎】
9 出芽酵母におけるAirIDによる相互作用因子の同定【河田美幸,関藤孝之】
10 ショウジョウバエ生体における近接依存性標識プロテオミクス【川口紘平,藤田尚信】

応用編

1 Split-BioID法とその派生技術の可能性【永本紗也佳,髙野哲也,奥山一生】
2 BioID法に用いる酵素の構造的特徴【寺脇慎一】
3 Fab抗体を用した膜タンパク質の細胞外相互作用解析【山田航大】
4 HRP標識抗体を用いた構造特異的膜タンパク質の解析【小川優樹】
5 BioID法で解き明かす生体脳の空間プロテオーム【伊藤有紀,髙野哲也】
6 短時間のPPIを解析するためのBioID酵素【山中聡士】

◆ 索引

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  • 【本書名】実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ:リアルな相互作用を捉える近接依存性標識プロトコール〜BioID・TurboID・AirIDの選択・導入から正しい相互作用分子の同定まで、論文には書かれていない実験のノウハウ
  • 【出版社名】羊土社

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