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木構造グラフを利用したクライオ電子顕微鏡データからのタンパク質立体構造のモデリング方法

Protein tertiary structure modeling from cryo-EM density maps by tree graph optimization
Terashi G & Kihara D:Nat Commun, 9:1618, 2018
寺師玄記,木原大亮
Genki Terashi1)/Daisuke Kihara1)2):Department of Biological Sciences, Purdue University1)/ Department of Computer Sciences, Purdue University2)(パデュー大学生物科学科1)/パデュー大学計算機科学科2)
10.18958/6233-00003-0001592-00

近年,生体分子の高解像度三次元電子顕微鏡マップ(電顕3Dマップ)の報告数が急速に増加している.しかし依然として,電顕マップからタンパク質分子の構造を決定する際には研究者の手作業によるモデリングが必須であった.本研究でわれわれは,電顕マップから三次元の木構造グラフが構築できることに着目し,全自動でタンパク質構造を構築する新手法を開発した.

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