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【スマホで読める実験医学】PacBio HiFiリードによるアカシソゲノム配列解読の実際
550円
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PacBio HiFiリードによるアカシソゲノム配列解読の実際
Keita Tamura1）2），Hidemasa Bono1）2）：Graduate School of Integrated Sciences for Life, Hiroshima University1）/Genome Editing Innovation Center, Hiroshima University2）（広島大学大学院統合生命科学研究科1）/広島大学ゲノム編集イノベーションセンター2））
10.18958/7281-00002-0000489-00
Nature Methods誌「Method of the Year 2022」にはロングリードシークエンシング技術が選ばれました．T2T（Telomere-to-Telomere）Consortiumにおける完全ゲノム解読への貢献，SARS-CoV-2の変異追跡への活用など，存在感を増すロングリードシークエンサーですが，「ロングリードがリピート配列や構造の解析，あるいはde novoに強いのはわかるけど，医学研究は精度が大事だからショートを使うよ」という方も多いと伺います．では，最近のアップデートでQ20（99%），さらにはQ30（99.9%）の精度がロングリードでも出るのだとしたら，いかがでしょうか．本コーナーでは，そんな今どきのロングリード事情をユーザー目線で解説いただきます．（編集部より）
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