UMIは6〜10塩基のランダム塩基配列であり,逆転写用のオリゴDNAに含まれ,mRNA 1種類につき1つのUMIが付加される.その後,ライブラリを増幅してシークエンスすると,cDNA配列とUMI配列の両方が読みとられる.もし1つの遺伝子から同じUMI配列が複数得られた場合は,1コピーのmRNAが過剰増幅された結果であると判定できる.逆に,1つの遺伝子から複数配列のUMIが検出された場合は,増幅前の正味のmRNAのコピー数としてカウントできる.(実験医学2021年9月号より)
Photo-Isolation Chemistry:光照射による高解像度かつ高感度なトランスクリプトーム技術実験医学2021年9月号RNA配列に付加されたタグ配列.scRNA-seqで得られたリードにはPCR増幅の産物を含むが,それらは同一のタグ配列(UMI)を含むため,マップされたリード中に含まれる異なるUMIの数を遺伝子ごとにカウントすることでPCR増幅前の分子数を推定することができる.(実験医学増刊3720より)
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シングルセルゲノミクス
組織の機能、病態が1細胞レベルで見えてきた!
ユニーク分子識別子は,分子タグを使用してユニークなmRNA転写産物を検出および定量するための配列.(実験医学増刊3720より)
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シングルセルゲノミクス
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本コンテンツは,2018年まで更新されていた同名コンテンツを元に,新規追加・再編集したものです