仮定されたモデルの下で，観測データの実現する確率が，そのモデルの尤もらしさ（尤度）とされる．分子系統樹の推定では，分子進化のモデルを仮定したうえで，候補となる系統樹が，与えられた配列データを実現する確率が計算され，樹形や枝長などの探索を通して得られた（対数）尤度最大となる系統樹が採用される．ここで紹介した研究では，系統樹と進化モデルはあらかじめ与えられており，マーカー遺伝子配列を系統樹のさまざまな候補位置に配置し，各々尤度が計算される．（バイオテクノロジージャーナル74より）

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牛島俊和／企画