実験医学別冊
メタゲノムデータ解析 16Sも! ショットガンも! ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ
- 2021年11月30日発行
- AB判
- 237ページ
- 付録：Annual Updateサービスの登録コード
- ISBN 978-4-7581-2255-9
- 6,930円（本体6,300円＋税）
- 在庫：あり
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医学・生物学の研究や創薬などの産業応用に役立つメタゲノムデータの解析法を，料理のレシピ本のようにわかりやすく解説．共生菌も環境微生物も，菌叢の組成も機能も，PCひとつでbon appetit！
目次
序文
著者一覧
Annual Updateについて
Chapter1 メタゲノムデータ解析に必要なコンピュータリテラシー
（1）Anaconda仮想環境とDocker【坊農秀雅】
（2）データ解析インフラ【久保竜一】
Chapter2 細菌叢の組成を調べる ─16Sアンプリコン解析
（1）Short read
① QIIME 2【志波 優】
② VITCOMIC2，LEA【森 宙史】
（2）Long read
① GenomeSync + GSTK法【KRYUKOV, Kirill，中川 草，松尾禎之，廣田喜一，今西 規】
② NanoGalaxy【大石直哉】
［COLUMN］DIYメタゲノム解析【大石直哉】
Chapter3 細菌叢の機能にまでふみこむ ─ショットガン解析
（1）メタゲノムアセンブリと系統解析 PhyloPhlAn3 + GraPhlAn【上坂一馬】
（2）アノテーション DFAST【谷澤靖洋】
［COLUMN］マイクロバイオームヘルスケア，はじめないか【坪井千明】
Chapter4 解析したデータを共有・利用する
（1）国際塩基配列データベースへの登録 メタゲノムアセンブリ，DRA，DDBJ【大城戸利久，福田亜沙美】
（2）figshare，生命科学系データベースアーカイブを使ったデータ共有【横井 翔】
（3）横断的に検索できる微生物統合データベース MicrobeDB.jp【伊藤光平】
索引
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- 【本書名】実験医学別冊：メタゲノムデータ解析 16Sも! ショットガンも! ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ
- 【出版社名】羊土社
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（2021年8月23日）
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