創薬に携わる製薬企業・アカデミアの研究者必読!アッセイ系の基本原理をもとに,手法の使い分け・系の構築の過程を,現場の研究者目線で丁寧に解説.必ず遭遇する問題への実践的な対処法を具体例とともに掲載.
目次
序
序章 総論―ようこそ「スクリーニング学」へ!【新井好史】
第1章 スクリーニングカスケード
1 スクリーニングカスケードの設定と戦略【新井好史】
第2章 創薬アプローチ(ターゲット別)
1 Target-Based ScreeningとPhenotypic Screening【岡部隆義】
2 酵素阻害(活性化)【武本 浩】
3 受容体結合阻害(活性化)【村越路子】
4 タンパク質 - タンパク質相互作用(PPI)を標的とした創薬【小田上剛直】
5 イオンチャネルをターゲットとしたスクリーニングの考え方【守口由紀子,我謝徳一】
第3章 アッセイ手法(検出・測定法別)
1 吸光度・濁度測定【佐藤朝実】
2 発光法【桃井道子】
3 蛍光法【高城多恵子,笹又美穂】
4 蛍光偏光【和田玲子】
5 ELISA法【出井晶子】
6 TR-FRET(HTRFとLANCE)【村越路子,武本 浩】
7 Alpha技術によるHTS【竹田浩之】
8 質量分析(MS)〜High-Throughout Mass Spectrometry(HTMS)【寺西文恵】
9 ラジオアイソトープ(RI:放射性同位元素)【佐藤秀樹,村越路子】
10 細胞イメージング【大野 研】
11 物理化学的手法 〜特異的相互作用を評価するための定量解析【長門石 曉,津本浩平】
12 レポーターアッセイとそのHTSへの応用【片岡健輔】
13 GPCRでよく使われるアッセイ【村越路子】
14 イオンチャネルをターゲットとした化合物スクリーニングの概要【日比野良祐,関 梓】
15 細胞毒性アッセイ【米倉慎一郎】
16 タンパク質断片相補アッセイ【出井晶子】
第4章 スクリーニング方法と結果の検証
1 アッセイ系評価【岡部隆義】
2 スクリーニング実施評価【和田玲子】
3 フォールスポジティブ・フォールスネガティブ【岡部隆義】
第5章 化合物ライブラリー
1 化合物ソースの種類(低分子,中分子),DEL【神山 務】
2 化合物管理 〜スクリーニングアッセイは化合物の分注からはじまる【髙宮万里】
3 化合物自動倉庫 〜導入に至る経緯と役割【濱田幸宣】
第6章 プレートアッセイ関連技術
1 マイクロプレートアッセイ【村越路子】
2 分注機の種類と特徴【樽井 寛】
3 プレートリーダー【菅 郷志】
4 アッセイに必要な周辺装置【笹又美穂,村越路子,内田 実】
第7章 自動化(オートメーション)
1 概論―実験の自動化の歴史を知り新たな革新へ【笹又美穂】
2 自動化に貢献する機器の進化 〜分注機を中心に【三井郁雄】
3 実験の自動化に関する基礎知識 〜周辺機器の特徴と選び方【笹又美穂,内田 実】
4 実験自動化システムの分類と導入時の考察ポイント【須山英悟】
5 自動化システムの構築にあたり知っておくべきこと【浅野秀光】
6 自動化システム実践編 “ソフトウェアと自動化” 〜ソフトウェア選択とエラー対策の重要性【内田 実】
第8章 ヒットtoリード
1 ヒットバリデーション【谷口友美】
2 リード認定・過程【神山 務】
第9章 特徴のあるスクリーニング
1 コンピュータを利用したバーチャルスクリーニング【大田雅照】
2 プーリングアッセイ【新井好史】
3 フラグメントベースドスクリーニング【幸 瞳】
4 天然物スクリーニング【村松康範,奥田彰文】
5 感染症スクリーニング【新井好史】
6 DNA encoded library(DEL)スクリーニング【須田三記也】
第10章 データ登録と網羅的解析
1 HTS データ処理 〜データの登録,可視化,網羅的解析【妹尾千明,和田玲子】
第11章 スクリーニング実施例
1 カップリング反応によるキナーゼ阻害剤のスクリーニング【今村理世】
2 Echo MSを利用したスクリーニング【長谷川 司】
3 HTRF法を用いた細胞系HTS【武本 浩】
4 ロミデプシンの発見に学ぶ系設計のノウハウ【上田博嗣】
索引
執筆者一覧
COLUMN
1 データ解析時の信頼性にかかわる用語【笹又美穂】
2 in vivo(個体)アッセイ【辻 直城】
3 IC50と阻害定数(inhibitor constant:Ki)の関係(酵素編)【新井好史】
4 結合実験(binding assay)の基本【新井好史】
5 競合実験(competition assay)におけるKiとIC50(結合阻害編)【新井好史】
6 界面活性剤(Detergent)をうまく使おう【笹又美穂】
7 クロストーク【工藤 勤】
8 クエンチング:カラークエンチングとケミカルクエンチング【工藤 勤】
9 ベイズの定理:ヒットしたのに再現性がない?【岡部隆義】
10 ライブラリー化合物の純度について【新井好史】
11 DMSOの怖い吸湿【髙宮万里】
12 撹拌が重要【村越路子,笹又美穂】
13 静電気によって発生する問題と対応について【内田 実】
14 リガンド効率(ligand efficiency:LE)【新井好史】
15 HTS実施時の試薬類,消耗品などの調達,調製【今村理世】
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- 【本書名】実験医学別冊:創薬研究のためのスクリーニング学実践テキスト〜アッセイ系の選択・構築から、ヒット・リード化合物の同定、自動化まで
- 【出版社名】羊土社
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(2021年8月23日)
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