フロントランナー直伝　相分離解析プロトコール

序【加藤昌人】

レビュー編

Ⅰ．概論

1　群れることの意味─非膜オルガネラの生理機能【春田奈美，中川真一】

Ⅱ．基礎知識

2　アミノ酸溶液とタンパク質溶液の基本的な性質【白木賢太郎】

3　Low-complexity配列による相分離・相転移機構【加藤昌人】

4　細胞内相分離におけるRNAの役割【山崎智弘，廣瀬哲郎】

プロトコール編

Ⅰ．in vitro（細胞外）

1　精製Atgタンパク質を用いたin vitro液滴形成と蛍光観察【藤岡優子】

2　精製FUSによる相分離の顕微鏡観察と温度依存性解析【吉澤拓也】

3　DNA/タンパク質相分離の再現実験【冨田峻介，三村真大】

4　人工細胞中での相分離観察【柳澤実穂，本田　玄，渡邊千穂】

5　リコンビナントlow-complexityドメインの精製法【加藤昌人】

6　ハイドロゲル結合実験によるlow-complexity配列の線維形成能の評価【加藤昌人】

7　Low-complexity配列に特異的に作用する低分子化合物 〜biotinylated isoxazoleと1,6-hexanediol【加藤昌人】

8　ラマン顕微鏡による相分離の定量解析【梶本真司，柴田大輝，中林孝和】

Ⅱ．in vivo（細胞内）

9　細胞内液滴の形成観察とFRAPによる動態観察【安田さや香，遠藤彬則，佐伯　泰】

10　低酸素条件下で形成する代謝酵素集合体の観察【三浦夏子】

11　タンパク質クラウディング状態の蛍光プローブによる測定【吉村成弘】

12　SNAP-tagを用いた一分子イメージング法【伊藤由馬，斉藤典子】

13　近位ビオチン標識法【栗原美寿々】

14　観察した液滴の画像解析による定量評価【渡邊謙吾】

15　過剰発現が引き起こす相分離構造と細胞毒性の評価【難波匠太郎，守屋央朗】

16　オプトジェネティクスによる相転移の操作【浅川和秀，半田　宏，川上浩一】

Ⅲ．in silico

17　液滴研究に関連したデータベースと解析プログラム【安保勲人，小澤侑平，太田元規，福地佐斗志】

発展編

1　CARS顕微鏡 〜Lipid dropletsからLiquid dropletsの可視化へ【加納英明】

2　新たな液中走査電子顕微鏡の開発と生物試料の直接観察【小椋俊彦】

3　中性子散乱【中川　洋，松尾龍人】

4　放射光円偏光二色性分光法による液 ‐ 液相分離の観測【藤井健太郎】

5　分子シミュレーションで理解する相分離のメカニズム【Cheng Tan，新津　藍，依田隆夫，杉田有治】

索引