RNA-seq

RNAを無作為に断片化しその塩基配列を次世代シークエンサーで決定することでRNAを測定する手法．配列の数え上げからRNAの発現量を，エクソン接合部の配列からスプライス・ジャンクションを観測できる．あらかじめ設計したプローブに依存するマイクロアレイに比べ，測定できるRNAの網羅性はきわめて高い．断片データよりRNA全長構造を推定する計算手法も提案されているが，その結果はあくまで推定であり，当該構造をもつRNA分子が観測された根拠とはならないことには注意が必要である．（実験医学2019年1月号より）