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メタ16S解析

めた16Sかいせき

すべての細菌種がもち,種の系統分類の指標として汎用される16S rRNA遺伝子の配列情報にもとづき,菌叢を構成する菌種組成を解析する手法.具体的には,種間で広く保存されている定常領域に設置したプライマー(universal primer)で菌叢を構成する菌種の16S rRNA遺伝子配列を網羅的に増幅する.その後,次世代シークエンサーによって大量に配列情報を取得することで,菌叢を構成する菌種を枚挙し菌種の相対組成量を明らかにできる.NGSによって得られる配列解析手法としては,OTU(operational taxonomic unit)解析やASV(amplification sequence variance)解析が用いられる.Qiime2などの統合ツール(https://qiime2.org)が汎用されている.(実験医学2021年10月号より)

唾液マイクロバイオームの基本的構造とその変動要因実験医学2021年10月号

解説は発行当時の掲載内容に基づくものです

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