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【スマホで読める実験医学】迅速な細菌種の組成解析
550円
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迅速な細菌種の組成解析
Rapid bacterial composition analyses using a nanopore-based sequencer
So Nakagawa1）2）/Satomi Mitsuhashi1）3）/Kirill Kryukov1）/Tadashi Imanishi1）：Department of Molecular Life Science, Tokai University School of Medicine1）/Micro/Nano Technology Center, Tokai University2）/Department of Human Genetics, Yokohama City University Graduate School of Medicine3）（東海大学医学部分子生命科学1）/東海大学マイクロ・ナノ研究開発センター2）/横浜市立大学医学部遺伝学3））
10.18958/5527-00001-0001467-00
16S rRNA遺伝子のアンプリコンシークエンスによる細菌組成の解析は，ナノポア技術に基づくシークエンサーMinIONの登場により大きく変わりつつある．ロングリードが得られること，そして逐次的なシークエンスが可能という特徴を活かして，われわれを含め世界各地の研究グループがMinIONを使ってさまざまなDNAサンプルの細菌組成を迅速に決定することに成功している．われわれはさらにこの機器のポータブルという特徴を活かし，MinIONとラップトップ型コンピューターを使って持ち運び可能な迅速細菌同定システムを構築した．このシステムは設備の整った研究室ではなくても，医療現場を含む世界各地のさまざまな場面で活躍できる可能性がある．
16S rRNA，ロングリードシークエンス，細菌叢，ポータブルゲノム解析
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