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【スマホで読める実験医学】ナノポアリードのアライメントツール
550円
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ナノポアリードのアライメントツール
Alignment tools for Nanopore reads
Hajime Suzuki/Masahiro Kasahara：Department of Computational Biology and Medical Sciences, Graduate School of Frontier Science, The University of Tokyo（東京大学大学院新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻）
10.18958/5527-00001-0001464-00
MinIONシークエンサーより得られたリード（MinIONリード）向けの解析ツールは非常に速いテンポで開発が進められており，数カ月単位で目まぐるしく変化する状況を捉えるのが難しくなっている．本稿では，われわれが開発しているアライメントツールminialignを中心に，MinIONリード向けのアライメントツールで主なものをわれわれの独断と偏見で紹介する．その他のツール（de novoアセンブラ，コンティグの塩基エラー訂正ツール，その他のユーティリティ）についても，MinIONリードに実用可能なツールをまとめた表を掲載する．
ロングリード，データ解析，アライメント，スプリットアライメント
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