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10x Visiumによる空間トランスクリプトーム解析

Spatial transcriptomics analysis using 10x Visium
水野 林,小林由佳,河岡慎平
Rin Mizuno1)/Yuka Kobayashi2)/Shinpei Kawaoka1):Inter-Organ Communication Research Team, Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University1)/Laboratory of Immunology, Institute for Frontier Life and Medical Sciences, Kyoto University2)(京都大学 ウイルス・再生医科学研究所 臓器連関研究チーム1)/京都大学 ウイルス・再生医医科学研究所 再生免疫学分野2)
10.18958/6889-00001-0000794-00

近年の空間トランスクリプトーム技術の発展には目をみはるものがある.その一方で,計測の専門性やコストが高く,気軽にやってみようとは思えない,と考えておられる方も多いのではないだろうか.どのような手順で準備をしていくのか検討もつかない,という方もいるだろう.われわれは最近,10x Visiumを用いた空間トランスクリプトーム実験にはじめてふれる機会を得た.本稿では,空間トランスクリプトーム未経験者であったわれわれが,どのようにこの新しい計測手法を学び,データを得ていったかを概説したい.

がん悪液質,肝臓,空間トランスクリプトーム,1細胞トランスクリプトーム

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