分子間相互作用解析ハンドブック

序【礒辺俊明 中山敬一 伊藤隆司】

第1章 タンパク質−タンパク質相互作用解析法

I)リバース・プロテオミクスによる解析法

1.ファージディスプレイ法【松原輝彦 佐藤智典】

2.酵母2ハイブリッド法の応用と1ハイブリッド法【山口佳洋 太田一寿 伊藤隆司】

3.哺乳類細胞ツーハイブリッド法【甲斐誓利 鈴木治和】

4.ファーウエスタン法【兼松 隆 藤井 誠 平田雅人】

II)プロテオミクスによる解析法

1.免疫沈降による内在性複合体の解析法【泉川桂一】

2.アフィニティークロマトグラフィー法 【高橋信弘 藤山沙理 千葉一裕】

3.エピトープタグ発現法 〜質量分析のためのサンプル調製法〜【家村俊一郎】

4.タンデムアフィニティータグ 発現精製法(TAP法)【垣内一恵 田岡万悟 市村 徹 礒辺俊明】

5.リバースタグ法/ダブルタグ法【早野俊哉】

6.化学的修飾法を利用したタンパク質相互作用解析法【中村立二 小田吉哉】

III)分子イメージングによる解析法

1.2分子FRETによる解析法 【中村岳史 松田道行】

2.FCSによる解析法【三國新太郎 金城政孝】

3.FCCSによるタンパク質相互作用解析【三國新太郎 小暮貴子 宮脇敦史 金城政孝】

4.1分子イメージングによる解析法【佐甲靖志】

IV)分光学的な解析法

1.SPRセンサーを用いたタンパク質相互作用の新規カイネティクス解析〜single cycle kinetics〜【橋本せつ子 森本香織】

2.NMRによる解析法【神田大輔】

V)情報処理技術を利用した解析法

1.KeyMolnetによる 分子ネットワーク解析【佐藤陽美 】

2.知識ベースを利用した分子間相互作用解析 〜IPAの利用法〜【二階堂 愛】

3.計算による相互作用の予測【佐藤哲也 金久 實 藤 博幸】

4.ドッキング計算によるタンパク質−タンパク質相互作用予測【広川貴次】

VI)その他の解析法

1.水晶発振子マイクロバランス法【古澤宏幸 岡畑惠雄】

2.等温滴定型熱量計を用いた分子間相互作用測定【宇於崎麻衣子 城所俊一】

3.超遠心分析によるタンパク質間相互作用の解析【有坂文雄】

第2章 タンパク質−核酸相互作用解析法

1.South-Western法【田中 卓 正井久雄】

2.UVクロスリンキング法【You Zhiying 正井久雄】

3.EMSA(Electrophoretic Mobility Shift Assay) 〜ゲルシフトアッセイ〜【石田尚臣】

4.DNaseフットプリンティング法【上田 均】

5.メチル化干渉法【上田 均】

6.クロマチン免疫沈降法(ChIP)【束田裕一】

7.ChIP-on-chip法【高橋康彦】

8.レポーターアッセイ【河合香代子 須藤龍彦】

9.酵母を用いたRNA/タンパク質スリーハイブリッドアッセイ法【高木正稔】

10.SPRを用いたタンパク質−核酸相互作用解析法【遠藤 慧 中村義一】

11.転写因子とシスエレメントの相互作用解析に役立つデータベースとウェブツール【蒔田由布子 中井謙太】

第3章 タンパク質−低分子相互作用解析法

1.核内受容体を用いた脂溶性生理活性物質の評価法【加藤茂明 藤木亮次】

2.化合物アレイを用いた低分子−タンパク質相互作用の検出【齊藤安貴子 叶 直樹 長田裕之】

3.表面プラズモン共鳴(SPR)バイオセンサーによるタンパク質−低分子化合物相互作用解析【諏訪頼正 並木直子】

4.シミュレーションソフトウェアによるタンパク質−リガンド相互作用解析【島田裕三】

5.分子動力学計算法によるタンパク質−リガンド相互作用解析【広川貴次】

第4章 タンパク質−糖・脂質相互作用解析法

1.レクチンアレイによる糖タンパク質の解析【久野 敦 平林 淳】

2.レクチンの糖結合特性の効率的解明 〜フロンタルアフィニティークロマトグラフィー〜【笠井献一】

3.リポソーム崩壊法による膜脂質作用性タンパク質の解析法【五十嵐浩二 梅田真郷】

4.スポットアレイ法によるタンパク質−脂質間相互作用の検出【伊藤俊樹 竹縄忠臣 】

5.リポソーム共沈法によるタンパク質−脂質間相互作用の検出【伊藤俊樹 竹縄忠臣 】

6.ELISAを利用したイノシトールリン脂質結合タンパク質の検出法【辻田和也】

7.SPRによるタンパク質−脂質相互作用解析法【有木 茂 川畑俊一郎】

●索 引