RNAiの発見からこれまで急速に進んできたノンコーディングRNA研究の総集編! マイルストーン論文200報分の研究史から,知っておいて損はないCLIPやCRISPRなどの実験手法までを1冊に凝集!
目次
序にかえて ―ノンコーディングRNA研究の潮流を読み,そして乗るために【塩見美喜子】
第1章 small RNAのマイルストーン研究
[総論] 小分子RNA研究の歴史と現状【塩見春彦】
RNAiとsiRNA(small interfering RNA)
1. 植物の「コサプレッション」が先駆けとなったRNAi研究【小宮怜奈】
2. RNAiの発見【永沼政広,泊 幸秀】
3. 線虫を用いたRNAi因子の遺伝学的スクリーニング【三木貴司】
4. ヒトRNAiの発見とその応用的意味【程 久美子】
5. ショウジョウバエRISCの構成因子Dicer-2とR2D2の発見と解析【Qinghua Liu,翻訳:塩見美喜子】
6. Argonauteの同定とRISC解析【塩見春彦】
7. 分裂酵母siRNAを介したTGS【山中総一郎】
8. 動物における内在性siRNAの発見と機能【平野孝昌】
miRNA(microRNA)
9. miRNA lin-4とlet-7の発見【八代悠歌】
10. miRNAの網羅的解析【三嶋雄一郎】
11. Droshaの同定と機能解析【塩見春彦】
12. miRNAによる標的制御 ―翻訳抑制とmRNA分解【山下暁朗】
piRNA(PIWI-interacting RNA)
13. piRNAの発見【齋藤都暁】
14. PIWIの機能解析:ショウジョウバエ【齋藤都暁】
15. PIWIの機能解析:マウス【蓮輪英毅】
16. piRNAクラスタ【岩崎由香】
17. piRNA増幅機構ピンポンサイクルの提唱とその解析【住吉哲太朗】
18. piRNA生合成因子Zucchiniの同定と機能解析【山城はるな】
19. 人工piRNAの発現と応用【石津大嗣】
その他のsmall RNA
20. CRISPRとsgRNA【佐藤 薫】
21. 原核生物の制御性RNAの発見と拡張【宮腰昌利】
第2章 長鎖ノンコーディングRNAのマイルストーン研究
[総論] 長鎖ncRNA研究の歴史と現状【中川真一】
転写制御lncRNA
1. 酵母SRG1,mlonRNAによる遺伝子発現制御【浅田隆大,廣田耕志】
2. ショウジョウバエroX RNA ─ヒストン修飾酵素複合体と相互作用するRNAの発見【影山裕二】
3. XistによるX染色体不活性化の制御【平谷伊智朗】
4. インプリントlncRNAによる染色体ドメインレベルの遺伝子発現制御【目黒牧子,堀家慎一】
5. ポストゲノム前夜に同定されたlncRNA ―SRAとEvf2【栗原由紀子】
6. ポストゲノム時代に同定された転写抑制型lncRNA群【神武洋二郎】
7. ポストゲノム時代に同定された転写活性化型lncRNA群 ―eRNAによる転写活性化のメカニズム【米田竜馬,黒川理樹】
核内構造体lncRNA
8. meiRNAによる減数分裂の制御【山下 朗】
9. 高発現量核内ncRNA ―転写を操る糸たち【秋光信佳】
10. ヒートショック誘導性lncRNAと核内構造体【二宮賢介,廣瀬哲郎】
11. パラスペックル ―NEAT1 lncRNAをコアとする核内構造体【山崎智弘,廣瀬哲郎】
12. 核小体の構造と機能を制御するlncRNA【奥脇 暢】
13. 染色体機能とlncRNA【若井道仁,中川真一】
細胞質lncRNA
14. small RNAスポンジとしてのlncRNA ―circRNA, ceRNA【芳本 玲】
15. lncRNAにおけるレトロトランスポゾンの機能【石田賢太郎】
その他のlncRNA関連トピック
16. 大規模トランスクリプトーム解析によるncRNAの発見【橋本浩介】
17. lncRNA複合体解析法の登場【中川真一】
18. 小さなペプチドの発見から学ぶ事【稲垣 幸,影山裕二】
19. lncRNA解析の問題点と遺伝学的解析【中川真一】
第3章 ncRNA研究と疾患,診断,創薬
1. miRNAネットワークとがん【鈴木 洋】
2. 生活習慣病とmiRNA ―miRNA-33a/bの生理機能【尾野 亘】
3. 骨・関節を守るmiRNA【森 雅樹,浅原弘嗣】
4. lncRNAによる発がん制御メカニズム【高山賢一,井上 聡】
5. 中枢神経系の発生・機能発現とncRNA【古川貴久】
6. 自己免疫疾患とRNA編集【三宅浩太郎,中濱泰祐,河原行郎】
7. Exosomal miRNAが魅せる新たな診断方法 ―身体にもお財布にも負担の少ない検査法の開発へ【吉岡祐亮,落谷孝広】
8. 転写後過程におけるmiRNAの制御【北條広朗,八代悠歌,鈴木 勉】
9. 核酸医薬の新たな標的 ―創薬へ向けた現状と展望【和田郁人,山本剛史,斯波真理子,小比賀 聡】
10. 核酸医薬のデリバリーシステム【江口暁子】
11. 核酸医薬品開発の動向【高垣和史】
第4章 ncRNA研究をはじめよう
1. RNA-seqを用いたlncRNAの同定【谷上賢瑞】
2. ncRNAのバイオインフォマティクス解析【岩崎由香,岩崎 渉】
3. 1細胞からのlncRNAの網羅的計測【二階堂 愛】
4. ノックダウンによるncRNAの機能解析 ―ヒトセントロメアncRNA解析を例に【井手上 賢】
5. CRISPR/Cas9によるゲノム編集【千葉朋希,浅原弘嗣】
6. RNA細胞内局在の高解像度解析【水戸麻理,中川真一】
7. ライブイメージング① ―点灯型蛍光オリゴヌクレオチドプローブを用いたncRNAの可視化【大本育実,王 丹】
8. ライブイメージング② ―MS2-GFPシステムを用いたRNAの可視化【増井 修】
9. RNP解析①:CLIP ―CLIP技術の進化と今後の展開【矢野真人,矢野佳芳】
10. RNP解析②:モノクローナル抗体の作製法【西田知訓,塩見美喜子】
付 録
1. ncRNA年表〜マイルストーン研究 特選200報〜【中川真一,塩見美喜子】
2. 代表的なncRNAカタログ【中川真一,浅原弘嗣,森 雅樹,千葉朋希】
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(2021年8月23日)
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