東京大学　バイオインフォマティクス集中講義

序
［基礎編］〜バイオインフォマティクスを学ぶ前に知っておこう

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講義1◆生物情報科学とは何か〜バイオインフォマティクスのなりたちとこれから 　＊生物情報科学のはじまり
　＊ゲノムインフォマティクスからバイオインフォマティクスへ
　＊生物情報科学に必要なコンピュータ技術
　＊生命科学としての生物情報科学
　＊生命のシステム的理解に向けて
　＊これからこの分野をめざす人へ

講義2◆生命科学からみた生物情報科学 　＊発生分化の基本分子機構
　＊木と森 ─ 若い生物情報科学者への期待

講義3◆情報科学の学び方〜バイオインフォマティクスの基礎として 　＊バイオインフォマティクスのための情報科学の基礎
　＊計算機システムの基礎
　＊ネットワーク管理
　＊プログラミング
　＊アルゴリズム
　＊動的計画法
　＊バックトラッキング
　＊形式言語
　＊情報理論・数理統計
　＊連続系アルゴリズム（数値解析）
　＊データベース・知識表現

講義4◆分子生物学，生化学，細胞生物学の基本〜バイオインフォマティクスの素材を理解する 　＊生物・細胞と遺伝子
　＊分子生物学の概念と遺伝子
　＊生化学と生体物質・生化学反応
　＊細胞生物学，分子細胞生物学とシグナル伝達


［応用編］〜バイオインフォマティクスの実際を学ぼう

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講義5◆DNA二重らせんの安定性を解く〜その理論と応用 　＊DNAのヘリックスコイル転移
　＊融解曲線の平衡論
　＊融解曲線の平衡論の応用

講義6◆計算手法を用いて見るタンパク質立体構造概論 　＊タンパク質構造の基礎概念
　＊タンパク質の構造比較および構造データベース

講義7◆膨大な遺伝子情報から機能を探る手法 　＊技術・学問の概要
　＊実際の解析における現状・問題点

講義8◆プロテオーム解析が切り開く生命科学の新しい方向 　＊プロテオーム解析の概要
　＊プロテオーム解析の現状・問題点

講義9◆知識発見技術入門 　＊数学で生まれ情報科学で育った知識発見技術
　＊機械学習　知識発見　データマイニング
　＊バイオインフォマティクスと知識発見
　＊クラスタリング
　＊クラス分類

講義10◆ゲノムデータベース入門〜つくる人と使う人のために 　＊ゲノムデータベースの基礎
　＊古典的データベース
　＊ゲノムデータベースの現状

講義11◆配列から生物学的な意味を探る〜配列解析 　＊遺伝子発見問題
　＊遺伝子配列の規則性を発見
　＊規則性のモデル化
　＊規則性の検証

講義12◆生物がもつ機能の原理を探る〜パスウェイデータベース 　＊パスウェイデータベースとは
　＊パスウェイデータベースの構造
　＊パスウェイデータベースを利用した研究のこれから

講義13◆細胞内のネットワークを解く〜分子ネットワークシミュレーション入門 　＊技術・学問の概要
　＊実際の解析における現状と問題点

【付録】初めて情報科学・生命科学を学ぶ方へ

　1．情報科学の教科書 　2．分子生物学，生化学，細胞生物学を非生物系専攻の学生・研究者が学ぶとき〜教科書と手引き