ここでは，欧米のSNP consortiumをいう．1999年4月にWellcome Trustおよび欧米の製薬企業10社程度が出資し，共同でSNPマップを作成するコンソーシアム（協同研究グループ）を結成した．目標は2年間で30万のSNPのマップを作成する．実際の解析は，米国のMITやWashington大学，Stanford大学および英国のSangerセンターで行われ，2000年2月には，すでに80万以上のSNPがデータベースに登録されている．また，データベースは一般に公開されている．
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