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トランスポゾンはゲノム上を転移するDNA配列であり,その転移は遺伝子構造を破壊することがあるため,宿主によって抑制されている.一方で,トランスポゾンやその断片配列はわれわれヒトゲノムの半分近くを占めており,ある意味われわれ自身でありながら敵のようなものであるという興味深い配列である.研究上では,ゲノム上に多コピーが存在するため扱いが難しく,普段のRNA-seqなどでは除かれることが多い配列である.
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