シングルセルゲノミクス

序にかえて－個体を分解して理解するシングルセルゲノミクス【渡辺　亮】

第1章　総論：プロジェクト・技術の動向

1．シングルセルゲノミクスのプラットフォーム【関　真秀，土屋一成，鹿島幸恵，鈴木絢子，鈴木　穣】

2．医学・生物学研究に実装されるシングルセルゲノミクス【渡辺　亮】

3．シングルセルRNA-seq情報解析最前線【中戸隆一郎】

4．世界と日本におけるHuman Cell Atlasの構築【Jay W. Shin，Piero Carninci，安藤吉成】

第2章　シングルセル解析によるバイオロジー

Ⅰ．発生・臓器・オルガノイド

1．心筋シングルセル解析による病態解明から臨床応用【野村征太郎，油谷浩幸】

2．腸管上皮のシングルセル解析【利光孝太，佐藤俊朗】

3．肝臓オルガノイドのシングルセル解析【佐伯憲和，武部貴則】

4．単細胞レベルでの膵内分泌細胞の不均一性と機能解明【龍岡久登，坂本智子，渡辺　亮，稲垣暢也】

5．シングルセル解析で広がるヒト腎臓発生と病態の理解【辻本　啓，長船健二】

6．シングルセルRNA-seqを用いた肺線維症の解析―データベースを用いた具体的な解析方法の紹介【金墻周平，後藤慎平】

Ⅱ．免疫・がん

7．シングルセルレベルでのT細胞受容体・B細胞受容体解析【冨樫庸介】

8．T細胞におけるシングルセル解析【安水良明，中村やまみ，大倉永也】

9．レンバチニブと抗PD-1抗体の併用による腫瘍免疫調節作用の解析【木村剛之，加藤　悠，船橋泰博】

10．大腸がん組織を構成する細胞集団の多様性【八尾良司，鈴木絢子，長山　聡】

11．シングルセル遺伝子発現解析からみえてきた腫瘍内不均一性【林　寛敦，秋山　徹】

12．成人T細胞白血病研究におけるシングルセル解析の有用性【山岸　誠，鈴木　穣，渡邉俊樹，内丸　薫】

13．HTLV-1感染動態の数理モデル型定量的データ解析【高木舜晟，安永純一朗，松岡雅雄，岩見真吾】

14．リキッドバイオプシーの実現に向けた血中循環腫瘍細胞のシングルセル解析【吉野知子，根岸　諒】

Ⅲ．その他

15．iPS細胞のシングルセル遺伝子発現解析【今村恵子，渡辺　亮，井上治久】

16．1細胞RNA-Seqによる神経前駆細胞の制御機構解析の動向【中西勝之，神山　淳】

17．ウイルス感染細胞の不均一性（heterogeneity）の網羅的描出【佐藤　佳，麻生啓文，小柳義夫】

18．メタゲノムデータからの微生物ゲノムの再構成【西嶋　傑】

第3章　技術開発

1．進歩を続ける1細胞トランスクリプトーム計測法【二階堂 愛】

2．シングルセルゲノム情報解析の基盤技術【二階堂 愛】

3．クロマチン挿入標識法（ChIL）による単一細胞エピゲノム解析【原田哲仁，大川恭行】

4．シングルセル遺伝子発現解析（Nx1-seq）と細胞集団【橋本真一】

5．C1 CAGE法を用いた一細胞転写開始点解析【Jonathan Moody，河野　掌，Andrew Tae-Jun Kwon，柴山洋太郎，Chung-Chau Hon，Erik Arner，Piero Carninci，Charles Plessy，Jay W. Shin】

6．マイクロバイオームのシングルセル解析【細川正人，小川雅人，竹山春子】

7．蛍光イメージングによる網羅的シングルセル解析【岡田康志】

8．SINC-seq法による1細胞多階層解析【新宅博文，小口祐伴，飯田　慶】

索引