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RNA機能構造の大規模解析システム『FOREST』の開発

RNA structure-wide discovery of functional interactions with multiplexed RNA motif library
Komatsu KR, et al:Nat Commun, 11:6275, 2020
宮下映見,小松リチャード馨,齊藤博英
Emi Miyashita1)2)/Kaoru R. Komatsu1)2)/Hirohide Saito1):Department of Life Science Frontiers, CiRA, Kyoto University1)/xFOREST Therapeutics2)(京都大学 iPS細胞研究所 未来生命開拓部門1)/xFOREST Therapeutics2)
10.18958/6797-00003-0000733-00

遺伝子発現や細胞運命の制御を司るRNAを発見するには,生命機能に重要なRNAの「配列と構造」の両情報が欠かせない.従来法では,両情報を大規模かつ定量的に取得することに課題があった.われわれは,数千から数万種類のRNA構造単位をライブラリー化し,標的因子とRNAの相互作用を大規模に解析・発見できるシステム,FOREST(folded RNA element profiling with structure library)を開発した.

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